Gnu R pour les courbes concentration-réponse

Publié le 16 août 2012

Suite à mon arti­cle sur l’uti­li­sa­tion de GnuR pour évaluer la sélec­ti­vité fonc­tion­nelle, il m’a été demandé de pro­duire un script plus simple ne per­met­tant que d’étudier les cour­bes concen­tra­tion-réponse. J’ai donc pris le temps de modi­fier mon script et d’exclure tout ce qui concer­nait la sélec­ti­vité fonc­tion­nelle. Il en résulte deux scripts, l’un per­met­tant d’évaluer le coef­fi­cient de Hill et l’autre non. Dans les deux script, le bruit de fond est sous­trait pour cha­cune des cour­bes pour situer la réponse mini­male à 0. L’équation uti­li­sée est la sui­vante, où B est la réponse maxi­male et D le coef­fi­cient de Hill :

 Y =  frac{B}{1 + (frac{X}{EC_{50}})^{D}} }

Voici un exem­ple de trai­te­ment de résul­tats par l’un de ces scripts.

D’autres fichiers Excel sont également géné­rés afin de pou­voir exploi­ter davan­tage vos résul­tats. Vous trou­ve­rez les scripts et un fichier de don­nées dans l’archive sui­vante :

BZip - 7.6 ko
Script R

Archive conte­nant les fichiers R.

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